مازوت سوزی نیروگاه نکا در فصل سرد سال یک رویه طبیعی شده که از سال 1386 تاکنون در حال انجام است و این مسئله الودگی هوای شرق مازندران را در پی دارد. به دلیل نبود تجهیزات سنجش آلودگی در استان مازندران، میزان این آلودگی مشخص نیست اما؛ مدیرکل محیط زیست مازندران با تایید مازوت سوزی این نیروگاه خواستار اختصاص مازوت با کیفیت بهتر شده است.